河长制管理信息系统整合当地省份河湖数据、物联网感知设施设备、排水泵站及污水处理厂 等河湖数据；实现各级河流在 GIS 系统中的展示、查询、统计、分析、快速录入等功能；通过互联网、 移动通信等技术与水务业务系统相结合；实现信息化的河道的养护、巡查管理，监督设施所有人、 管理人和河长制管理和日常管理工作。 系统主要功能包括：河长制综合展示、一张图、河湖治理、清四乱、水质管理、采砂管理、河道 巡查等内容。

1.河长制综合展示

        河长制综合展示子模块主要包括河湖长数量统计、巡河综合信息、最新水质情况、待办事项、清四乱情况。河湖长数量统计包括（省、市、县区、乡镇、村级）河湖长、（省级、市级、县区级、乡镇级）河长办、河湖数量数据统计。

2.一张图展示

图是将公示牌、界碑、河流信息、河段信息、岸线、监测站、饮用水源、污染源、排污口、水资源分区、引调水工程等信息集中于一张图上，实现各类信息的综合化展示。

3.河湖治理

        河湖治理功能包括河长信息、河湖调查、一河一策、一河一档、两表三清单、一河一治、清四乱、水质情况。其中河湖调查由取水口、排水口、排污口、沿河工业企业、沿河养殖场、沿河垃圾、居民聚集区、河道内采砂、涉水建筑物、桥梁、拦河闸坝、生产生活污染、农田侵占、河湖现状、水闸等信息组成。两表三清单由问题清单、目标责任清单、目标任务分解、河长制任务清单、措施责任清单组成。

4.清四乱

清四乱包括最新清四乱数量、清四乱事件问题状态以及与上月清四乱对比情况。

5.河道采砂

        河道采砂主要包括河流采砂许可证情况、采砂量、采砂情况描述、自检以及审核情况等内容。